全科医学的分类诊断，不是一个独立的概念，它是临床心理分类诊断和精神医学分类诊断的一种结合。
关于精神疾病的分类，在国际上使用的是“精神和行为障碍”的分类系统。其中有两大分类系统，一个是世界卫生组织制定的《国际疾病分类》第10版(ICD-10，)，另一个是美国的《精神障碍诊断统计手册》第4版(DSM-IV，)。我国经过多年的使用和修订出版了《中国精神疾病分类方案与诊断标准(CCMD-2-R，)，最近又出了新版(CCMD-3，)。
根据我国的精神疾病分类方案与诊断标准，心理障可以分为两大范围。
（一）精神病性障碍
临床中表现为严重精神疾病的症状，如有妄想、幻觉，情感淡漠或不协调，意志障碍和行为严重反常，没有自知力等。
主要的疾病有精神分裂症、脑器质性精神障碍、躯体疾病所致的精神障碍、偏执性精神病、情感性精神障碍等。
（二）非精神病性精神障碍
主要表现为不具备精神病性症状，而是出现焦虑、紧张、恐惧、抑郁、强迫、疑病等症状或有人格方面的改变。起病与心理社会因素有关。病人能了解和认识自己的患病情況，有求医的愿望。
主要疾病有神经症、饮食障碍、睡眠与觉醒障碍、心因性性功能障碍、人格障碍等。
需要指出的是，无论是全科医生还是心理健康方面的专业人员，如果过分地把注意力集中在对来访者或病人进行客观化的疾病归类，常常会忽视人性层面的内容。因此全科医生既要把医学的诊断标准作为重要的临床参考依据，同时也应充分了解来访者的个体特性，不要把所有的来访者都用看待病人的眼光去看待他们。
对于全科医生的专业要求不同于职业心理医生及精神科医生，所以一般不主张在工作中完全套用精神疾病的诊断标准，可以就社区人群最常见的心理题进行归类，可以分为神经症、青少年发展和适应问题、行为异常问题、急性境遇适应问题、边缘性人格问题及精神分裂症等，这样的归类便于全科医生对心理问题的识别和处理。
1.神经症
神经症在人群中的发病情况很普遍。患者的最大特征是自我结构是健全的。意识一般都清楚，表现条理分明，有责任感，举止合宜，与外界能保持接触，有要求诊治的主观愿望。神经症的起病与个性和心理社会因素有关，可有精神及躯体症状的体验却得不到明显的器质性病变的阳性指标。神经症包括抑郁症、焦虑症、恐怖症、强迫症、疑病症、癔症等。
2.青少年发展和适应问题
这不是病理心理的专业名词，它只是指青少年在成长过程中和社会适应方面表现出的挫折和阻滞状态。青少年可以因此而表现为与家人的沟通不良、人际关系不好、学习困难、失恋等。
3.行为异常问题
患者有某些难以自控的习惯行为，往往是一种环境适应不良的表现。常常可伴有反社会倾向、酗酒、药瘾等。他们对自己的行为表现不以为然，也很少有不安和罪恶感。他们的求助动机一般较弱，即使有也不会持久。
4.急性境遇适应问题
由于突如其来的社会生活事件，如车祸、被强暴、丢失大量钱、查出恶病等，一时承受不住重大压力而产生的暂时的精神崩潰。如果原来心理素质较差，就有可能引发神经症或其他心理障碍。
5.边缘性人格问题
边缘性(bordline)在临床中是不易被确切归类的含义，并非是指已濒临精神异常。它也不同与神经症，主要是由于自幼成长过程中自我功能发展受阻在往后心态方面的异常表现。患者表面上如同常人，但与其广泛接触后会发现其不成熟、肤浅、不稳定和退缩。他们对于现实的评价在认知方面存在较多的曲解，以致往往是某些歪道邪说的心服者。在与他们的早期接触中似乎他们也能表现出合作信任的关系，但他们的内心深处却蕴着抵触和愤怒。对于这些患者的药物治疗的疗效有限，而用心理分析治疗和认知治疗能达到一定的疗效。
6.精神分裂症
这是常见的精神疾病。由于病人思维素乱、感知障碍、情绪异常，伴有意志行为障碍，又无自知力，所以在发病期间应医院，运用药物进行治疗。在精神分裂症的缓解期，在有充分适应证的情况下也可转介给心理医生接受系统的心理治疗。
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