功能性消化不良的发病是生物因素和社会心理因素复合作用的体现，脑肠轴功能的失调是功能性消化不良发病的核心机制。
脑肠轴的调节功能主要体现在不同发病因素发起的各种信号从肠道传递到中枢神经系统，传递到胃肠道内的各种靶细胞，调控胃肠道的感觉、动力和分泌。
功能性消化不良产生的原因
1、胃肠动力障碍
胃肠道动力障碍是功能性消化不良发病的重要机制，胃肠动力不足为功能性消化不良最直接的表现，其作用机制与胃排空延迟、餐后胃底容受性舒张受限及胃对容量扩张的敏感性增加有关。
2、精神心理因素
功能性消化不良是一种典型的身心疾病，多数情况下功能性消化不良多伴有不同程度的焦虑、抑郁、躯体化等精神障碍。
这些异常精神障碍主要来源于神经官能症、植物神经功能紊乱和焦虑、躯体疾病、不良生活应激事件、异常个性特征和应对方式等。
3、脑肠轴功能障碍与胃肠激素改变
脑-肠轴是将CNS、肠神经系统及ANS连接的一种神经双向通路，机体通过脑-肠轴之间神经-内分泌网络的双向环路进行脑肠互动，功能性消化不良及肠易激综合征患者的发病与脑肠轴功能的异常相关。
4、生活应激
生活应激在功能性消化不良的发病中发挥重要作用，食物不耐受或过敏可能诱发功能性消化不良，高脂饮食通过改变胃肠激素的水平来影响胃十二指肠的病理生理机制。
4、感染与炎症相关因素
胃肠道感染后会导致IBS也可能会引起功能性消化不良，沙门氏菌、大肠杆菌、空肠弯曲菌、贾第鞭毛虫及诺如病*都可能会诱发功能性消化不良。
另一引起功能性消化不良的感染性因素可能是幽门螺杆菌的感染，约有5%的消化不良由幽门螺杆菌感染引起。
约有40%的功能性消化不良患者中发现同时存在十二指肠炎，特别是十二指肠嗜酸性粒细胞的增多，部分患者可伴有过多的嗜酸性粒细胞和嗜酸性粒细胞脱颗粒与神经毗连。
十二指肠嗜酸性粒细胞的增多与吸烟、早饱感以及疼痛相关。因此，器质性机制可能参与了部分功能性消化不良患者症状的改善。
功能性消化不良患者改变不良的生恬习惯避免长期过度劳累，养成良好的作息习惯，戒除烟、酒等不良嗜好。治疗时要特别注意消除社会因素产生的精神紧张、忧郁、焦虑等。
或可通过中医药进行身体上的调理，中医博大精深，对功能性消化不良辨证治疗有优势，因此可以咨询专业中医医师的意见和建议，制定相对应的治疗方案，对症治疗。
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